Indagato nel 2016, Carmignani è attualmente sotto inchiesta con le accuse, tra l'altro, di peculato d'uso.
"Con l'atto di revoca l'amministrazione comunale, pur confidando nell'accertamento della verità giudiziaria - si legge in una nota del comune - ha inteso andare a ricostruire un clima di serenità all'interno dell'ambiente. Infatti nelle ultime ore sono emersi elementi che attengono ad alcuni rapporti interni al Comando di piazzale San Donato e che costituiscono un significativo aggravamento della posizione di Carmignani.
L'amministrazione ha disposto nel contempo anche il trasferimento di Stefano Carmignani ad altro ufficio e la nomina nel ruolo di comandante di Polizia Municipale di Maurizio Prina, attualmente dirigente dei servizi alle imprese, attività edilizia, istruzione, programmazione e controlli, Urp".